Characterization of a long non-coding RNA associated with colorectal cancer (CRC) predisposition

Abstract

Le varianti genetiche associate a un aumento del rischio di cancro sono spunti preziosi per ampliare le conoscenze in merito alla biologia e al trattamento dei tumori. Il rischio genetico è in maggior parte dovuto a mutazioni a bassa e media penetranza (ad esempio polimorfismi a singolo nucleotide - SNPs) che possono essere identificate con studi di associazione genome-wide (GWAS). Questi approcci hanno dimostrato che il 93% degli SNP associati al cancro risiede in regioni non codificanti del genoma. Pertanto, al fine di identificare nuovi trascritti non codificanti associati alla predisposizione, abbiamo intersecato le coordinate genomiche delle sonde microarray con gli SNP associati al cancro secondo GWAS. In questo modo, abbiamo identificato un RNA lungo non codificante (lncRNA), chiamato LINC00675, che si trova molto vicino a due SNP associati alla predisposizione del tumore del colon-retto. LINC00675 è espresso nel tratto gastrointestinale, in particolare nelle cellule apicali del villo intestinale, e la sua espressione correla con una miglior prognosi in pazienti affetti da tumore del colon-retto. Studiando l'effetto degli SNP sull'espressione di LINC00675, abbiamo individuato un polimorfismo che regola la stabilità del suo RNA. Inoltre, abbiamo scoperto che LINC00675 è coinvolto nella respirazione mitocondriale, nel metabolismo cellulare e nella capacità invasiva delle cellule tumorali. Concludendo, abbiamo identificato il LINC00675 come un nuovo lncRNA associato alla predisposizione del tumore del colon-retto ed il suo coinvolgimento nel metabolismo e nell'invasività cellulare apre intriganti spunti di indagine sul suo ruolo nella biologia e nella terapia dei tumori.